ГБУЗ МО «Подольская городская клиническая больница № 3» является объединением, в которое входят:
- Стационар на 135 коек: ревматологическое отделение, терапевтическое отделение (в.ч. нефрология), неврологическое отделение, гастроэнтерологическое отделение;
- Поликлиническое отделение «Шепчиники» – на 250 посещений в смену;
- Поликлиническое отделение «Кутузово» – на 250 посещений в смену;
- Гастроэнтерологический центр;
- Женская консультация;
- Стоматологическое отделение;
- Отделение лучевой диагностики;
- Отделение функциональной диагностики;
- Отделение восстановительного лечения;
- Отделение медицинской профилактики;
- Клинико-диагностическая лаборатория (в т.ч. бактериологическая лаборатория);
- Административно-хозяйственные подразделения.